RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SERAC1Q96JX3 654 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 RBBP8Q99708 897 aa5.36□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SLC2A11Q9BYW1 496 aa5.36□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.36□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 TREX1Q9NSU2 369 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TDP1Q9NUW8 608 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 VPS28Q9UK41 221 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TLK1Q9UKI8 766 aa5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.36□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 LCHNA4D1U4 455 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 MROH6A6NGR9 719 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 HIDE1A8MVS5 230 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 GOLGA8RI6L899 631 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 GRM6O15303 877 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SNX3O60493 162 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 UGT1A9O60656 530 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 VAPBO95292 243 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TGDSO95455 350 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SYN1P17600 705 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 PSMA3P25788 255 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ETV4P43268 484 aa5.35□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CD151P48509 253 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SCNN1BP51168 640 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CLCN5P51795 746 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SLC12A2P55011 1212 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 MAXP61244 160 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 RHOAP61586 193 aa5.35□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 ASPHQ12797 758 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SEPT6Q14141 434 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 GRM3Q14832 879 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 RAB30Q15771 203 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CNGA3Q16281 694 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 PCSK7Q16549 785 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 FSTL4Q6MZW2 842 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CES3Q6UWW8 571 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SPATA21Q7Z572 469 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SRLQ86TD4 932 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 PGBD5Q8N414 524 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 DCLK2Q8N568 766 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
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CKAP5-211ENST00000532321 GDAP1Q8TB36 358 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 RDH11Q8TC12 318 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF398Q8TD17 642 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 WBP2Q969T9 261 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ALG14Q96F25 216 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 VPS39Q96JC1 886 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TRIB3Q96RU7 358 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SLC22A12Q96S37 553 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 TCF12Q99081 682 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 GPR22Q99680 433 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.35□□□□□ -1.55
CKAP5-211ENST00000532321 CEP44Q9C0F1 390 aa5.35□□□□□ -1.55
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