RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GALNTL6Q49A17 601 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RAB41Q5JT25 222 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HECTD3Q5T447 861 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LHX8Q68G74 356 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CORO6Q6QEF8 472 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ASRGL1Q7L266 308 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TET1Q8NFU7 2136 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GIPC3Q8TF64 312 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HMCESQ96FZ2 354 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM237Q96Q45 408 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA3CQ99985 751 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 EHD1Q9H4M9 534 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GKN1Q9NS71 199 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PSAT1Q9Y617 370 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB16A2A368 324 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM64BA6NI03 449 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HHLA1C9JL84 531 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CCL22O00626 93 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RHOCP08134 193 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NMBRP28336 390 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KRT6CP48668 564 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 BCAP31P51572 246 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 KDSRQ06136 332 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT2Q10471 571 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DLG2Q15700 870 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ALFQ53S48 1182 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL22Q6P050 247 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NT5C3BQ969T7 300 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RTP4Q96DX8 246 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF558Q96NG5 402 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CPNE1Q99829 537 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CTRCQ99895 268 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GIN1Q9NXP7 522 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.89□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CENPBD1B2RD01 187 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 I6L893 689 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 J3KR12 359 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CBX6O95503 412 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CBX5P45973 191 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HCAR3P49019 387 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 AQP5P55064 265 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PFKPQ01813 784 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCAPQ12770 1279 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GPR17Q13304 367 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 CDH18Q13634 790 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 FITM2Q8N6M3 262 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TTC8Q8TAM2 541 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 EME1Q96AY2 570 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GCNAQ96QF7 691 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ACSS2Q9NR19 701 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ARMCX1Q9P291 453 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SCML2Q9UQR0 700 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 RAD54BQ9Y620 910 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 NEMP1O14524 444 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 MATN3O15232 486 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GYG2O15488 501 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TYROBPO43914 113 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ICMTO60725 284 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-DQB2P05538 268 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 ENO1P06733 434 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINF2P08697 491 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 EVI2BP34910 448 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 GMPRP36959 345 aa7.88□□□□□ -1.15
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN7P41732 249 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms