RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAB27AP51159 221 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EFNA5P52803 228 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HDAC4P56524 1084 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNX16P57768 344 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPARDQ03181 441 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF543Q08ER8 600 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRMPQ12912 555 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SOWAHAQ2M3V2 549 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUBB8Q3ZCM7 444 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTCAP3Q53RY4 240 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF569Q5MCW4 686 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RGMBQ6NW40 437 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AADACL2Q6P093 401 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM122CQ6P4D5 195 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SFTPA2Q8IWL1 248 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC39A11Q8N1S5 342 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GALNT15Q8N3T1 639 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2AK2Q8NG84 335 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR52I2Q8NH67 350 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP70Q8NHQ1 597 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHKBQ93100 1093 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARRDC3Q96B67 414 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINGO1Q96FE5 620 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF285Q96NJ3 590 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CMKLR1Q99788 373 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSD2Q9BQI7 771 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HAUS8Q9BT25 410 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLPBQ9H078 707 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCNN2Q9H2S1 579 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ADPRHL2Q9NX46 363 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKRD10Q9NXR5 420 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL42Q9P2K6 505 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MOB4Q9Y3A3 225 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa0.59□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A0U1RQF3 1178 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1W2PPR1 153 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR6C68A6NDL8 312 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A18PA6NE21 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM247A6NEH6 219 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A16PA6NEW6 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KPNA5O15131 536 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC22A2O15244 555 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CAVIN2O95810 425 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL1AP01583 271 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A15PP0C7V4 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A14PP0C7W9 464 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SRD5A1P18405 259 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ITIH1P19827 911 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DRD3P35462 400 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 USP8P40818 1118 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTGER3P43115 390 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTNR1AP48039 350 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PGFP49763 221 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMP14P50281 582 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MCL1Q07820 350 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RAPSNQ13702 412 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEDD9Q14511 834 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPE65Q16518 533 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AP5B1Q2VPB7 878 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA1644Q3SXP7 199 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMEL1Q495T6 779 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEL1L3Q68CR1 1132 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CES5AQ6NT32 575 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANKRD54Q6NXT1 300 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRBA2Q6ZNG9 492 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MFSD6Q6ZSS7 791 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SH2D5Q6ZV89 423 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LURAP1LQ8IV03 231 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRSK2Q8IWQ3 736 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARP8Q8N3A8 854 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCDC33Q8N5R6 958 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PARP16Q8N5Y8 322 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HMGCLL1Q8TB92 370 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HMGB4Q8WW32 186 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF183Q96D59 192 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF26Q96DR7 871 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCRN2Q96FV2 425 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RTN4RQ9BZR6 473 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C17orf75Q9HAS0 396 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms