RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 VIPR1P32241 457 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 VAV2P52735 878 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 THOP1P52888 689 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AP1B1Q10567 949 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP5AQ14642 412 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AGERQ15109 404 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PROX2Q3B8N5 592 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC12Q5T9G4 340 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS13Q6UX07 377 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PHACTR4Q8IZ21 702 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ10AQ96MF6 247 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IL12RB2Q99665 862 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC61Q9BV99 259 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ASXL3Q9C0F0 2248 aa18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 CST8O60676 142 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM16O95361 564 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PRLP01236 227 aa18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC50Q8IVM0 306 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C6Q8NH72 309 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT43Q96FT9 208 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PDXPQ96GD0 296 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT10Q9P0V9 454 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PHTF1Q9UMS5 762 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CHKBQ9Y259 395 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 U3KQA8 63 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 EPG5Q9HCE0 2579 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 GRID2IPA4D2P6 1211 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM149AA5PLN7 773 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 GCATO75600 419 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV3P41162 512 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CD86P42081 329 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 YPEL5P62699 121 aa18.74■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC66Q68CR7 880 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LPCAT1Q8NF37 534 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 NUS1Q96E22 293 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 APOOQ9BUR5 198 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 BPTFQ12830 3046 aa18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0J9YYE9 177 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP69A5D8W1 941 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BM21 787 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PJA2O43164 708 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 RFPL3O75679 317 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBC1P01850 177 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 C1SP09871 688 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 HNF1BP35680 557 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 MTM1Q13496 603 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf61Q13536 156 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PDK1Q15118 436 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB133Q30KQ1 61 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AADACL2Q6P093 401 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1328Q86T90 577 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 LMX1AQ8TE12 382 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 DTD2Q96FN9 168 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP3Q96P47 875 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 CLPBQ9H078 707 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF22Q9HCT0 170 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AMACRQ9UHK6 382 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CD84Q9UIB8 345 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQ67 120 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.72■□□□□ 0.59
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