RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa12.15□□□□□ -0.46
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SIGLEC6O43699 453 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIAS2O75928 621 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM16O95361 564 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDHA1P08559 390 aa12.14□□□□□ -0.47
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYF5P13349 255 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 JUNDP17535 347 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VIPR1P32241 457 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDKN2BP42772 138 aa12.14□□□□□ -0.47
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZBTB17Q13105 803 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1orf61Q13536 156 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CNGA3Q16281 694 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RALGPS1Q5JS13 557 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAXCQ5TGI0 409 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBFAQ8N0V3 343 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LMX1AQ8TE12 382 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HAUS1Q96CS2 278 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HES6Q96HZ4 224 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AMFRQ9UKV5 643 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHKBQ9Y259 395 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPEGQ15772 3267 aa12.14□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A1W2PQ67 120 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC66A2RUB6 948 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA6CA6NDK9 693 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA6BA6NDN3 693 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 H3BM21 787 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CST8O60676 142 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FTCDO95954 541 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSF2P04141 144 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA6DP0CG33 693 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GM2AP17900 193 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD86P42081 329 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPHB1P54762 984 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLDN6P56747 220 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 YPEL5P62699 121 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADCY2Q08462 1091 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTK2BQ14289 1009 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDK1Q15118 436 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DHRS13Q6UX07 377 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RD3Q7Z3Z2 195 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PEX26Q7Z412 305 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HID1Q8IV36 788 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PELI3Q8N2H9 469 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM58Q8NG06 486 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ALG3Q92685 438 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FATE1Q969F0 183 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFT43Q96FT9 208 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AGAP3Q96P47 875 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 APOOQ9BUR5 198 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12.13□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPRBP23467 1997 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFAP69A5D8W1 941 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM149AA5PLN7 773 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 K7ESM1 405 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1QTNF9P0C862 333 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ALPPL2P10696 532 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LHCGRP22888 699 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HNF1BP35680 557 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ETV3P41162 512 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACADVLP49748 655 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DAB2P98082 770 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGEF7Q14155 803 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TFDP2Q14188 446 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DEFB133Q30KQ1 61 aa12.12□□□□□ -0.47
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.12□□□□□ -0.47
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