RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CDK4	P11802	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NAGA	P17050	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CD58	P19256	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PIGA	P37287	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GPS2	Q13227	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NAE1	Q13564	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TRIB2	Q92519	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1B0GVT2	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		A8MZ25	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		J3KR12	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802		K7ENM7	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	OVOL3	O00110	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	TIMM23	O14925	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	VILL	O15195	856 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A12	O75746	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ALOX12	P18054	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GPT	P24298	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PRAME	P78395	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MC1R	Q01726	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CREB5	Q02930	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CRYM	Q14894	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ASAP2	O43150	1006 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	HCRTR2	O43614	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFS3	O75489	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2C1	O95371	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CYC1	P08574	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PSMB10	P40306	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	UBA7	P41226	1012 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NUDT6	P53370	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CDH8	P55286	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NLRP5	P59047	1200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CUL4A	Q13619	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NEDD9	Q14511	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKAP2-208	ENST00000495802	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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