RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LCA5Q86VQ0 697 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 SNX31Q8N9S9 440 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 RANBP9Q96S59 729 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 ZNF385DQ9H6B1 395 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 GALNT8Q9NY28 637 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 FNIP2Q9P278 1114 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 MT-CO1P00395 513 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 THRAP10827 490 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 ATF6P18850 670 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 CLCN5P51795 746 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 PKNOX1P55347 436 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 SULT2A1Q06520 285 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 IL10RBQ08334 325 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 GSTA3Q16772 222 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 ZNF549Q6P9A3 640 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 DHDDSQ86SQ9 333 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 DSELQ8IZU8 1212 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 EXT2Q93063 718 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 ITFG2Q969R8 447 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 TADA1Q96BN2 335 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 EXOC2Q96KP1 924 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 CDRT15Q96T59 188 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 SPON2Q9BUD6 331 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-213ENST00000492657 CCDC162PA2VCL2 907 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF11O60813 436 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 GJB5O95377 273 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MTTPP55157 894 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 RPS24P62847 133 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PFKPQ01813 784 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R3AQ16821 1122 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 AGAP9Q5VTM2 703 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CALML6Q8TD86 181 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 UBXN10Q96LJ8 280 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MFSD1Q9H3U5 465 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CCDC160A6NGH7 325 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SLC7A4O43246 635 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 NPHS1O60500 1241 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 DNAJB1P25685 340 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 DPP6P42658 865 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 RGRP47804 291 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF8P60827 252 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 ZNF235Q14590 738 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 RAET1EQ8TD07 263 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CNDP1Q96KN2 507 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 NPAS2Q99743 824 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PDP2Q9P2J9 529 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 MOXD2PA6NHM9 499 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 TBC1D4O60343 1298 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SELPP16109 830 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 HDCP19113 662 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 LIN52Q52LA3 116 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SFT2D3Q587I9 215 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 AAGABQ6PD74 315 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 KYQ8NBH2 561 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 FATE1Q969F0 183 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PTERQ96BW5 349 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 LRRC14BA6NHZ5 514 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 TBKBP1A7MCY6 615 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 TRPA1O75762 1119 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 ALDH1A1P00352 501 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 GALTP07902 379 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 RAG1P15918 1043 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PEX2P28328 305 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 SGSHP51688 502 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 THOP1P52888 689 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 AQP4P55087 323 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 DNAJB13P59910 316 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-213ENST00000492657 PTPRRQ15256 657 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms