RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491013.5

FDPS-216, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene FDPS, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-216ENST00000491013 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 COQ10AQ96MF6 247 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 A0A0J9YYE9 177 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CCDC66A2RUB6 948 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 H3BM21 787 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PSMD11O00231 422 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ENC1O14682 589 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PRLP01236 227 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TRBC1P01850 177 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 MMP2P08253 660 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CA4P22748 312 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 LHCGRP22888 699 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CTNNA2P26232 953 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KIF5AQ12840 1032 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ACOX1Q15067 660 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 USP45Q70EL2 814 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 OR4C6Q8NH72 309 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 DESI2Q9BSY9 194 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 APOOQ9BUR5 198 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CHKBQ9Y259 395 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.72□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 FRYQ5TBA9 3013 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NEMP2A6NFY4 417 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TRIM38O00635 465 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SCAMP1O15126 338 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SIGLEC6O43699 453 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PCCBP05166 539 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ALPIP09923 528 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 JUNDP17535 347 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CTPS1P17812 591 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SPINK2P20155 84 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 HNF1BP35680 557 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TRIM23P36406 574 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 CD86P42081 329 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 SKOR1P84550 965 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ARHGEF7Q14155 803 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NFATC4Q14934 902 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PTPRRQ15256 657 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PROX2Q3B8N5 592 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TEX44Q53QW1 395 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 BBS12Q6ZW61 710 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 P3H4Q92791 437 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 TBATAQ96M53 351 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 RP1P56715 2156 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 IGF2RP11717 2491 aa14.71□□□□□ -0.05
FDPS-216ENST00000491013 A0A0U1RQJ8 604 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 AQP9O43315 295 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 C1SP09871 688 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 ZNF30P17039 623 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 CKMT2P17540 419 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 PTPN3P26045 913 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 HTR1BP28222 390 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 PTPN7P35236 360 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 EPHB1P54762 984 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 RWDD2BP57060 319 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 PPARDQ03181 441 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 DNAJC3Q13217 504 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 SLC14A2Q15849 920 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 PNCKQ6P2M8 343 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.7□□□□□ -0.06
FDPS-216ENST00000491013 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.7□□□□□ -0.06
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