RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CHST14Q8NCH0 376 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 OR4K2Q8NGD2 314 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 HEPHQ9BQS7 1158 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 RHOJQ9H4E5 214 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF711Q9Y462 761 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0J9YYE9 177 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TRBC1P01850 177 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 VOPP1Q96AW1 172 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ECHDC3Q96DC8 303 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 VPS39Q96JC1 886 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MCMBPQ9BTE3 642 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GPR63Q9BZJ6 419 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 AHSGP02765 367 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 UGT2B4P06133 528 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 F7P08709 466 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ALPIP09923 528 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRRQ15256 657 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GDPD4Q6W3E5 623 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PHTF2Q8N3S3 785 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ACMSDQ8TDX5 336 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SGSM3Q96HU1 749 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 APOPT1Q96IL0 206 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PHTF1Q9UMS5 762 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQ67 120 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC162PA2VCL2 907 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 STX7O15400 261 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ZWINTO95229 277 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PSMA3P25788 255 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 HADHAP40939 763 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MPP1Q00013 466 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 DCLK2Q8N568 766 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 KDM1BQ8NB78 822 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 BRD9Q9H8M2 597 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 COPEO14579 308 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TPP1O14773 563 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CCNFP41002 786 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ABCG1P45844 678 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 HTR4Q13639 388 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC14Q15048 493 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ZSWIM9Q86XI8 627 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 UCMAQ8WVF2 138 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SPOCK2Q92563 424 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PKP3Q9Y446 797 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 OR51F1A6NGY5 319 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CAPN8A6NHC0 703 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ANHXE9PGG2 379 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GABRB3P28472 473 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TYK2P29597 1187 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 LSP1P33241 339 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CD151P48509 253 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINB8P50452 374 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 OR4L1Q8NH43 312 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 COL4A3Q01955 1670 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 ARNTLO00327 626 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TM9SF1O15321 606 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 HNF1BP35680 557 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 HMGCLP35914 325 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 USP45Q70EL2 814 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL32Q96NJ5 620 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 GPR22Q99680 433 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 CATSPERZQ9NTU4 200 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 IL36AQ9UHA7 158 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms