RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487525.5

RAD51C-211, Transcript of RAD51 paralog C, humanhuman

TSL 5

Gene RAD51C, Length 1,253 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51C-211ENST00000487525 FZD2Q14332 565 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 LRRC14Q15048 493 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 NOMO1Q15155 1222 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PTPRRQ15256 657 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 IRF4Q15306 451 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SLC14A2Q15849 920 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CNGA3Q16281 694 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 ACTL9Q8TC94 416 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 COQ10AQ96MF6 247 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.064e-12■■■■■ 42
RAD51C-211ENST00000487525 GLOD4Q9HC38 313 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.67□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 A0A0J9YYE9 177 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PSMD11O00231 422 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 TJP3O95049 919 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 TRBC1P01850 177 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 ALPIP09923 528 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CTPS1P17812 591 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CA4P22748 312 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 HNF1BP35680 557 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 BNIP3Q12983 259 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 USP45Q70EL2 814 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 GLRX5Q86SX6 157 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SMIM14Q96QK8 99 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 LYSMD1Q96S90 227 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 VAT1Q99536 393 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.66□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 NRDCO43847 1150 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 RBL1P28749 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 GRK6P43250 576 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 FOXK2Q01167 660 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 QPCTQ16769 361 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CCDC181Q5TID7 509 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 ZNF567Q8N184 647 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 TRIB3Q96RU7 358 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.65□□□□□ -0.06
RAD51C-211ENST00000487525 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 CAPN8A6NHC0 703 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 H7C0C1 242 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 CSF2P04141 144 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 ITGAVP06756 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 ADRB1P08588 477 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 RBP3P10745 1247 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 TRIM23P36406 574 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 ATP5OP48047 213 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 EPHB1P54762 984 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 PTSQ03393 145 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 MTM1Q13496 603 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 PTK2BQ14289 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 INPP5AQ14642 412 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 ACOX1Q15067 660 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 CDKN3Q16667 212 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 PID1Q7Z2X4 250 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 PARGQ86W56 976 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 SLC25A45Q8N413 288 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 DTD2Q96FN9 168 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 FCRL5Q96RD9 977 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 APOOQ9BUR5 198 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 KLF15Q9UIH9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.64□□□□□ -0.07
RAD51C-211ENST00000487525 SPTBN2O15020 2390 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms