RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	IQCB1	Q15051	598 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	HSPH1	Q92598	858 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.95	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1W2PQC6	194 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269		D6RAR5	112 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TNF	P01375	233 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	RARA	P10276	462 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT10	P13645	584 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	DES	P17661	470 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CR2	P20023	1033 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	LHCGR	P22888	699 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM23	P36406	574 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA1024L	P59773	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	MAX	P61244	160 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TRAF2	Q12933	501 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	NR1I3	Q14994	352 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ACOX1	Q15067	660 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CNGA3	Q16281	694 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	DENND2C	Q68D51	928 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	GKN2	Q86XP6	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF843	Q8N446	348 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269		B4DGG1	531 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269		H3BRJ5	948 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	MAFK	O60675	156 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PCK1	P35558	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ETV3	P41162	512 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF165	P49910	485 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TMPRSS3	P57727	454 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	AP1S1	P61966	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CLN3	Q13286	438 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	IHH	Q14623	411 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
FAM204A-208	ENST00000487269	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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