RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 H7C0C1 242 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PLK4O00444 970 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 NPC1O15118 1278 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RASA4O43374 803 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MAN1A2O60476 641 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OPHN1O60890 802 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FSBPO95073 299 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 APOEP02649 317 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 VAV1P15498 845 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PMLP29590 882 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 STX2P32856 288 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MAGEA6P43360 314 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ATP5OP48047 213 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DYNLT1P63172 113 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BNC1Q01954 994 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GRIK2Q13002 908 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CDH18Q13634 790 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CCDC38Q502W7 563 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 EFHC2Q5JST6 749 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PALM2Q8IXS6 379 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MCUQ8NE86 351 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OR2T3Q8NH03 318 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FIBINQ8TAL6 211 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CEP76Q8TAP6 659 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MDM1Q8TC05 714 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CPT1BQ92523 772 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IGSF8Q969P0 613 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 AZIN2Q96A70 460 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MYO19Q96H55 970 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MAGEB18Q96M61 343 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SMC6Q96SB8 1091 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KLC2Q9H0B6 622 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SIK2Q9H0K1 926 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 TMEM245Q9H330 911 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 RRN3Q9NYV6 651 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.33□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GVT2 93 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 F5H5T6 163 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 M0QYT0 321 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MID1O15344 667 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BNIP3LO60238 219 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SH3BP5O60239 455 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DAB1O75553 588 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SUN1O94901 812 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZWINTO95229 277 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 IGLV3-25P01717 112 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 DNTTP04053 509 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 GSTA1P08263 222 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 FBXO45P0C2W1 286 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CD59P13987 128 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 KRT15P19012 456 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 OXTRP30559 389 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ARL4AP40617 200 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 MATKP42679 507 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 PSMD8P48556 350 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 SULT1E1P49888 294 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 METAP1P53582 386 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 ST8SIA6P61647 398 aa6.32□□□□□ -1.4
MITF-215ENST00000478490 BASP1P80723 227 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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