RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 PRRT3Q5FWE3 981 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 LVRNQ6Q4G3 990 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 MARCH9Q86YJ5 346 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PLD5Q8N7P1 536 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 LMX1AQ8TE12 382 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 SEMA3CQ99985 751 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CLPBQ9H078 707 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 NT5MQ9NPB1 228 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ACACAQ13085 2346 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TNFRSF10CO14798 259 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TEAD1P28347 426 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TAZQ16635 292 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ARMC12Q5T9G4 340 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC170Q8IYT3 715 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 WDR92Q96MX6 357 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 IL12RB2Q99665 862 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 NRSN2Q9GZP1 204 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 HAUS2Q9NVX0 235 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.351e-10■■■□□ 17.4
C9orf3-215ENST00000478473 OR1A2Q9Y585 309 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RAI2Q9Y5P3 530 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CHD6Q8TD26 2715 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RASGRP1O95267 797 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CCNB1P14635 433 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TSHRP16473 764 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 FECHP22830 423 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 LHCGRP22888 699 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RTP5Q14D33 572 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 FAXCQ5TGI0 409 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PNCKQ6P2M8 343 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 MDM1Q8TC05 714 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 DTD2Q96FN9 168 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CLCA2Q9UQC9 943 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 LRP4O75096 1905 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 LRRD1A4D1F6 860 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 YY2O15391 372 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 OPA1O60313 960 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 MAP3K6O95382 1288 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PCCBP05166 539 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PDHA1P08559 390 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 SRP54P61011 504 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ELOCQ15369 112 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 DEFB133Q30KQ1 61 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ENPP7Q6UWV6 458 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 USP45Q70EL2 814 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 ZFHX4Q86UP3 3567 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 NLRP8Q86W28 1048 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 OLFM3Q96PB7 478 aa23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
C9orf3-215ENST00000478473 PRLP01236 227 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 ALPIP09923 528 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 KELP23276 732 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 CLDN6P56747 220 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 DPTQ07507 201 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 C1orf61Q13536 156 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 ACOX1Q15067 660 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 PAF1Q8N7H5 531 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 LYSMD1Q96S90 227 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 TEX101Q9BY14 249 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 KLQ9UEF7 1012 aa23.45■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 ASXL3Q9C0F0 2248 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 A0A0J9YYE9 177 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM202A6NGA9 273 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 MT-CO3P00414 261 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 TRBC1P01850 177 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 HLA-DQB2P05538 268 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 ANXA6P08133 673 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 KRT10P13645 584 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 MAGEA1P43355 309 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 DSC2Q02487 901 aa23.44■■□□□ 1.34
C9orf3-215ENST00000478473 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms