RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM186A	A6NE01	2351 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095		A0A0J9YYE9	177 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	POM121B	A6NF01	834 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TLR4	O00206	839 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FPGT	O14772	594 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	LIAS	O43766	372 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TRBC1	P01850	177 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FGG	P02679	453 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	PCCB	P05166	539 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	PIRT	P0C851	137 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	THEGL	P0DJG4	465 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	PSMB4	P28070	264 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	HNF1B	P35680	557 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IGFALS	P35858	605 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	GDF10	P55107	478 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	NXPH1	P58417	271 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ARHGAP8	P85298	464 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IL9R	Q01113	521 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SNX1	Q13596	522 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ACOX1	Q15067	660 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IRF4	Q15306	451 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	QPCT	Q16769	361 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	HLA-B	Q31612	363 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	LIPI	Q6XZB0	460 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	NETO1	Q8TDF5	533 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	RMDN1	Q96DB5	314 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IFT43	Q96FT9	208 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SCRN2	Q96FV2	425 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	VAT1	Q99536	393 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	GBA3	Q9H227	469 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	USP29	Q9HBJ7	922 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CAPN8	A6NHC0	703 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095		A6NNZ2	444 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC4A1	P02730	911 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	GM2A	P17900	193 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	NFKBIA	P25963	317 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ETV3	P41162	512 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CTSK	P43235	329 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CHRNA4	P43681	627 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	WNT3A	P56704	352 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CDK18	Q07002	472 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ARHGEF7	Q14155	803 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	LRRC14	Q15048	493 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	FAXC	Q5TGI0	409 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	LRRC66	Q68CR7	880 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095		Q6ZSR6	202 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	ASB12	Q8WXK4	309 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	SKA1	Q96BD8	255 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC6-222	ENST00000478095	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		10.29	□□□□□ -0.76

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