RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EDAQ92838 391 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 Q96MF0 132 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR88Q9GZN0 384 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MST1RQ04912 1400 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMTA2O94983 1202 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 DRD4P21917 467 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRC2P26717 231 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ACADLP28330 430 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX2P48431 317 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPAP49450 140 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R40P59535 323 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4F2P78329 520 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 DLG2Q15700 870 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM198Q66K66 360 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 UEVLDQ8IX04 471 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM47BQ8NA70 645 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY11Q96G91 374 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AK8Q96MA6 479 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ADOQ96SZ5 270 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A3Q99624 504 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MMP27Q9H306 513 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 HIPK3Q9H422 1215 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 OLAHQ9NV23 265 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-209ENST00000473406 ENO4A6NNW6 628 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00473A8K010 186 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KLRF2D3W0D1 207 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC188H7C350 402 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF263O14978 683 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB14O43829 449 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 DAB1O75553 588 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 GCATO75600 419 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2ABP04908 130 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM200BP0CF97 657 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SRCP12931 536 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 P4HA1P13674 534 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H2ADP20671 130 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CD86P42081 329 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ARSEP51690 589 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCNKBP51801 687 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF131P52739 623 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF10Q13118 480 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 RCN2Q14257 317 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 PPA1Q15181 289 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CBWD6Q4V339 395 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SYTL3Q4VX76 610 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 NOXA1Q86UR1 476 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM74Q86UV6 250 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM73Q86UV7 250 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-209ENST00000473406 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms