RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 PRSS44E7EML9 344 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CD58P19256 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 STX2P32856 288 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CPOXP36551 454 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PEX5P50542 639 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CALCRLQ16602 461 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ALG11Q2TAA5 492 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 AMZ1Q400G9 498 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 ALFQ53S48 1182 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 LINGO2Q7L985 606 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 TSPYL6Q8N831 410 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 C3orf30Q96M34 536 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 GPR108Q9NPR9 543 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 MKLN1Q9UL63 735 aa6.85□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 TAF4O00268 1085 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CLDN14O95500 239 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 CASP6P55212 293 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SNTA1Q13424 505 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 WDR73Q6P4I2 378 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SAAL1Q96ER3 474 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 KXD1Q9BQD3 176 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 TINAGQ9UJW2 476 aa6.84□□□□□ -1.31
SGCE-210ENST00000472326 LRRC53A6NM62 1247 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GABRB2P47870 512 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 NAE1Q13564 534 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 FGFBP1Q14512 234 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 DSELQ8IZU8 1212 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 IGSF21Q96ID5 467 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 NDST4Q9H3R1 872 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 BRF2Q9HAW0 419 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.83□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 IFITM10A6NMD0 228 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 USP17L23D6RBM5 183 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 TGFB1I1O43294 461 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE7O76087 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 PMS2P2O95744 297 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE12FP0CL80 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE12GP0CL81 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE12IP0CL82 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 UBL4AP11441 157 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 DAOP14920 347 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ICAM3P32942 547 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 DDIT3P35638 169 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE1Q13065 139 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAGE4Q13068 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GSTA3Q16772 222 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 DLK2Q6UY11 383 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 PIP5K1AQ99755 562 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 WDR26Q9H7D7 661 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GUV1 79 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 CDAP32320 146 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GAS1P54826 345 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ERVFC1-1P60608 527 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 NAXEQ8NCW5 288 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 METTL6Q8TCB7 284 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 TANKQ92844 425 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 GTF3C6Q969F1 213 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 BICD1Q96G01 975 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.81□□□□□ -1.32
SGCE-210ENST00000472326 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.8□□□□□ -1.32
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