RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-208ENST00000471880 PPARDQ03181 441 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TCEAL1Q15170 157 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 PTPRRQ15256 657 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 CNGA3Q16281 694 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 MACC1Q6ZN28 852 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 MAML1Q92585 1016 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 NUS1Q96E22 293 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 IFT43Q96FT9 208 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TSGA13Q96PP4 275 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 IL12RB2Q99665 862 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 DESI2Q9BSY9 194 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 APOOQ9BUR5 198 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 SPASTQ9UBP0 616 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 KLQ9UEF7 1012 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.85□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 A0A0U1RQS6 177 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 RCCD1A6NED2 376 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 AQP9O43315 295 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 PDHA1P08559 390 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 CKMT2P17540 419 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 CES1P23141 567 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 CLDN6P56747 220 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 ZBTB17Q13105 803 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 NFATC4Q14934 902 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 PCSK7Q16549 785 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 ST3GAL2Q16842 350 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 OR4C6Q8NH72 309 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 ATL2Q8NHH9 583 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 P3H4Q92791 437 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 SMIM14Q96QK8 99 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 KLF15Q9UIH9 416 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.84□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 APC2O95996 2303 aa14.83□□□□□ -0.03
SSR4-208ENST00000471880 ZNF487B1APH4 448 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 F5H423 210 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 SLC4A1P02730 911 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ANXA6P08133 673 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CTNNA2P26232 953 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CDC25BP30305 580 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 HNF1BP35680 557 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ETV3P41162 512 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CDKN2BP42772 138 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ACADVLP49748 655 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 BLKP51451 505 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 VAV2P52735 878 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 MTM1Q13496 603 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 VSIG1Q86XK7 387 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 KRT35Q92764 455 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 WDR92Q96MX6 357 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 WDR26Q9H7D7 661 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 GPR27Q9NS67 375 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 AMACRQ9UHK6 382 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CD84Q9UIB8 345 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 MSRB2Q9Y3D2 182 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 RP1P56715 2156 aa14.83□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 ACACAQ13085 2346 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CPED1A4D0V7 1026 aa14.82□□□□□ -0.04
SSR4-208ENST00000471880 CFAP69A5D8W1 941 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms