RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SNAP23	O00161	211 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CHL1	O00533	1208 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ITM2A	O43736	263 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SOX30	O94993	753 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MLYCD	O95822	493 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ITGAX	P20702	1163 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CXCR3	P49682	368 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		Q0VFX4	171 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GVT2	93 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KRT10	P13645	584 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ETFA	P13804	333 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TM4SF1	P30408	202 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SHMT1	P34896	483 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GRIK3	Q13003	919 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CUL4A	Q13619	759 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SHB	Q15464	509 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	VILL	O15195	856 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KLK8	O60259	260 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TSPAN9	O75954	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RGS11	O94810	467 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GLUD1	P00367	558 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS2	P07478	247 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NGFR	P08138	427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MMP2	P08253	660 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CBSL	P0DN79	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	AGA	P20933	346 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CCKAR	P32238	428 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CBS	P35520	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	THPO	P40225	353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73

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