RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 TOR1BO14657 336 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 SH3BP5O60239 455 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 KCNK5O95279 499 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 TRBC1P01850 177 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ALPIP09923 528 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 RBL1P28749 1068 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 IGFALSP35858 605 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 THOP1P52888 689 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PTK2BQ14289 1009 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 AGERQ15109 404 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 IRF4Q15306 451 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 WSCD2Q2TBF2 565 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PPM1JQ5JR12 505 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 IFT43Q96FT9 208 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 KCTD5Q9NXV2 234 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 FLRT2O43155 660 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHGA12O60330 932 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PRLP01236 227 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ITGAVP06756 1048 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 CEACAM1P13688 526 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 HNF1BP35680 557 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 RXRGP48443 463 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 YPEL5P62699 121 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 GSE1Q14687 1217 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 CNGA3Q16281 694 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PCSK7Q16549 785 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 INAVAQ3KP66 663 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PIP4P1Q86T03 277 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 NAXDQ8IW45 347 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF567Q8N184 647 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PCNX2A6NKB5 2137 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PSMD11O00231 422 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 ZSCAN12O43309 604 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PMPCBO75439 489 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PCCBP05166 539 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 NFKB1P19838 968 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PFN3P60673 137 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 PTPRRQ15256 657 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 SLC14A2Q15849 920 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 UBP1Q9NZI7 540 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ABCD4-202ENST00000460308 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 KCNN4O15554 427 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF30P17039 623 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 LHCGRP22888 699 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CDK18Q07002 472 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 BNIP3Q12983 259 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MTM1Q13496 603 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 INPP5AQ14642 412 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC66Q68CR7 880 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PARGQ86W56 976 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 NUS1Q96E22 293 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 COQ10AQ96MF6 247 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GPR27Q9NS67 375 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CAPN8A6NHC0 703 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 HTR1BP28222 390 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GRK6P43250 576 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FZD2Q14332 565 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GALNT3Q14435 633 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SHBQ15464 509 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 QPCTQ16769 361 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms