RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 KRT37O76014 449 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 LHCGRP22888 699 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 DSC2Q02487 901 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf61Q13536 156 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 ACOX1Q15067 660 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRRQ15256 657 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 ALG11Q2TAA5 492 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB133Q30KQ1 61 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 FAXCQ5TGI0 409 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HES3Q5TGS1 186 aa23.74■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 CCNYQ8ND76 341 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 NBEAQ8NFP9 2946 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 PIH1D2Q8WWB5 315 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 SCRN2Q96FV2 425 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TFR2Q9UP52 801 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 PPIL1Q9Y3C6 166 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TPP1O14773 563 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 SPOPO43791 374 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HLA-DQB2P05538 268 aa23.73■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 PANX2Q96RD6 677 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 CLPBQ9H078 707 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 LMO7DNF2Z398 122 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 APOL1O14791 398 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TSHRP16473 764 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 CES1P23141 567 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 NFKBIAP25963 317 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HTR1BP28222 390 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HK3P52790 923 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.72■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 ENPP7Q6UWV6 458 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 ALPIP09923 528 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 CTPS1P17812 591 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 HNF1BP35680 557 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM23P36406 574 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 BLKP51451 505 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1024LP59773 190 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 USP45Q70EL2 814 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 NUS1Q96E22 293 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXB3-202ENST00000460160 WDR92Q96MX6 357 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 SMIM14Q96QK8 99 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.71■■□□□ 1.39
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HOXB3-202ENST00000460160 TAF4O00268 1085 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 RASGRP1O95267 797 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 JCHAINP01591 159 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 SRP54P61011 504 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 SPA17Q15506 151 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 DENND2CQ68D51 928 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 PNCKQ6P2M8 343 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXB3-202ENST00000460160 RFX6Q8HWS3 928 aa23.7■■□□□ 1.38
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