RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STARD5Q9NSY2 213 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM51Q9NW97 253 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ADAM22Q9P0K1 906 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 APPL1Q9UKG1 709 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FZD10Q9ULW2 581 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FLNCQ14315 2725 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RELNP78509 3460 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 A0A0U1RQS6 177 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 A0A1W2PQC6 194 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TSPAN11A1L157 253 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PRSS38A1L453 326 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ANKRD62A6NC57 917 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP42A6NI28 874 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SIGLEC16A6NMB1 481 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EFCAB7A8K855 629 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 A8MU76 341 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 WASH4PA8MWX3 477 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STMND1H3BQB6 276 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TERTO14746 1132 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFRSF10CO14798 259 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 EPHB6O15197 1021 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DAPK3O43293 454 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SUV39H1O43463 412 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PRAMEF11O60813 436 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PPFIA2O75334 1257 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PALMO75781 387 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ECEL1O95672 775 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CPNE6O95741 557 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ITGB2P05107 769 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF1P05230 155 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CALB1P05937 261 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TPM2P07951 284 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PRKAR1AP10644 381 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SFTPCP11686 197 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CCNB1P14635 433 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 LIFP15018 202 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PNLIPP16233 465 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 DESP17661 470 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CTPS1P17812 591 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GM2AP17900 193 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PSMA2P25787 234 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CD82P27701 267 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CD1CP29017 333 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SERPINA4P29622 427 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CSF2RBP32927 897 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ETV3P41162 512 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 STAT1P42224 750 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 MAPK9P45984 424 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ATP1A2P50993 1020 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SCNN1BP51168 640 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ARSDP51689 593 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 NDST2P52849 883 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 JAM2P57087 298 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KIAA1024LP59773 190 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 B4GALNT1Q00973 533 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 OGDHQ02218 1023 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TLE1Q04724 770 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 BCL2L1Q07817 233 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 GRM3Q14832 879 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PTPRRQ15256 657 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 KRT31Q15323 416 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 IGFBP7Q16270 282 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CNGA3Q16281 694 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 CA9Q16790 459 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SKIDA1Q1XH10 827 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SNAP47Q5SQN1 464 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 FKBP15Q5T1M5 1219 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM164Q5U3C3 297 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 AFMIDQ63HM1 303 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 SMYD5Q6GMV2 418 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.72□□□□□ -1.97
SNORD109B-201ENST00000458961 PNCKQ6P2M8 343 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms