RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451422.1

ANKRD28-204, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 2,485 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-204ENST00000451422 PDK3Q15120 406 aa7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.56□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 PAOXQ6QHF9 649 aa7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 C8orf48Q96LL4 319 aa7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 SPON2Q9BUD6 331 aa7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 CYP2S1Q96SQ9 504 aa7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.55□□□□□ -1.2
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ANKRD28-204ENST00000451422 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 A0A0U1RQS6 177 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 H3BMM5 538 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 TLR5O60602 858 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ANKRD28-204ENST00000451422 PGM3O95394 542 aa7.54□□□□□ -1.2
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