RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447698.5

STRADB-204, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene STRADB, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-204ENST00000447698 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 TSPAN33Q86UF1 283 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 SCRN2Q96FV2 425 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 COQ10AQ96MF6 247 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 APOOQ9BUR5 198 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa23.41■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 OR1A2Q9Y585 309 aa23.41■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 JUNDP17535 347 aa23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 PELI3Q8N2H9 469 aa23.4■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.4■■□□□ 1.34
STRADB-204ENST00000447698 HAUS1Q96CS2 278 aa23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.4■■□□□ 1.34
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STRADB-204ENST00000447698 GIMD1P0DJR0 217 aa23.39■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 HNF1BP35680 557 aa23.39■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 SKOR1P84550 965 aa23.39■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 MTM1Q13496 603 aa23.39■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 MACC1Q6ZN28 852 aa23.39■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 USP45Q70EL2 814 aa23.39■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.39■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 H3BM21 787 aa23.38■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.38■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.38■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 A0A0J9YYE9 177 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 K7ESM1 405 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 TRBC1P01850 177 aa23.37■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 C1orf61Q13536 156 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 ARHGEF7Q14155 803 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 NFATC4Q14934 902 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 PPP2R5EQ16537 467 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 PROX2Q3B8N5 592 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 FAXCQ5TGI0 409 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 CRTC1Q6UUV9 634 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 ENPP7Q6UWV6 458 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.37■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 LMX1AQ8TE12 382 aa23.37■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 NUS1Q96E22 293 aa23.37■■□□□ 1.33
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STRADB-204ENST00000447698 NEMP2A6NFY4 417 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 SCAMP1O15126 338 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 AQP9O43315 295 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 CA4P22748 312 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 PTPN3P26045 913 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 ACADVLP49748 655 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 GSDMDP57764 484 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 PPARDQ03181 441 aa23.36■■□□□ 1.33
STRADB-204ENST00000447698 TEX44Q53QW1 395 aa23.36■■□□□ 1.33
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