RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPP6	Q9NZW5	540 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRELID1	Q9Y255	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	DRGX	A6NNA5	263 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARNTL	O00327	626 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CEP104	O60308	925 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACNG3	O60359	315 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	TULP3	O75386	442 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	FTCD	O95954	541 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	S100A6	P06703	90 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCRH	P07919	91 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOT1	P17174	413 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	DRD1	P21728	446 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTNNA2	P26232	953 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINB3	P29508	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5D	P30049	168 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1E1	P30953	314 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINB6	P35237	376 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ETFB	P38117	255 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NNMT	P40261	264 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	HCAR3	P49019	387 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAPKAPK2	P49137	400 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNA2	P51530	1060 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	GALK1	P51570	392 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SGSH	P51688	502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	KDSR	Q06136	332 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC12A1	Q13621	1099 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC32	Q14392	662 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	INPP5A	Q14642	412 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PON2	Q15165	354 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS6KA1	Q15418	735 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R7	Q15435	360 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	DPYSL2	Q16555	572 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CA9	Q16790	459 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RFX8	Q6ZV50	586 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	AHI1	Q8N157	1196 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	EDA	Q92838	391 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGSF8	Q969P0	613 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRBF2	Q96F24	287 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRELD1	Q96HD1	420 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CIPC	Q9C0C6	399 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD320	Q9NPF0	282 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASSF1	Q9NS23	344 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	OGFR	Q9NZT2	677 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	DNAI1	Q9UI46	699 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	WASH4P	A8MWX3	477 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM72C	H0Y354	149 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638		I6L893	689 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	GFRA2	O00451	464 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	APOL1	O14791	398 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKAP10	O43572	662 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAMP2	O60895	175 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	NEBL	O76041	1014 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNTN5	O94779	1100 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	KAT7	O95251	611 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASL	P04424	464 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41

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