RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423113.5

ITGB1-205, Transcript of integrin subunit beta 1, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene ITGB1, Length 3,729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-205	ENST00000423113	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ARC	Q7LC44	396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PKP2	Q99959	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ITGB1-205	ENST00000423113		A0A1W2PRG6	482 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		H3BMQ9	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SNAP91	O60641	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	OAZ2	O95190	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	IFNA16	P05015	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ME2	P23368	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SOX11	P35716	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CYP2J2	P51589	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	WNT7B	P56706	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HERC3	Q15034	1050 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ACAP2	Q15057	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DGUOK	Q16854	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	COG8	Q96MW5	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		H0Y858	1186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113		H3BNH8	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PDPK1	O15530	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	GPC4	O75487	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	GCNT3	O95395	438 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	VNN1	O95497	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NR3C1	P04150	777 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SERPINA6	P08185	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PFKL	P17858	780 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CD247	P20963	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HOXA9	P31269	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	UQCRC1	P31930	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	SOX5	P35711	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CENPA	P49450	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ACOT2	P49753	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	HK2	P52789	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	DYNLT1	P63172	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	GCNT1	Q02742	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	RAB30	Q15771	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	INSC	Q1MX18	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-205	ENST00000423113	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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