RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS6KA6Q9UK32 745 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ASPAP45381 313 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 RNFT2Q96EX2 444 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 NELL1Q92832 810 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 SNED1Q8TER0 1413 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 UBXN8O00124 270 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MATN3O15232 486 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT14O95848 222 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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