RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 DSC1Q08554 894 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ADCY1Q08828 1119 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PTK6Q13882 451 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CCNG2Q16589 344 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TAZQ16635 292 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FAM209AQ5JX71 171 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 OSTM1Q86WC4 334 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 METTL23Q86XA0 190 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 C12orf29Q8N999 325 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 LPPQ93052 612 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 LRRC45Q96CN5 670 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SENP8Q96LD8 212 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GNRHR2Q96P88 292 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 LMF1Q96S06 567 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ15Q99712 375 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ERP44Q9BS26 406 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.73□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ESYT3A0FGR9 886 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 LRRD1A4D1F6 860 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 F8VP50 259 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PRPSAP2O60256 369 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SPATA31D3P0C874 917 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KLRC2P26717 231 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ADORA2BP29275 332 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FLT3P36888 993 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CDKN2BP42772 138 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 AIF1P55008 147 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NTHL1P78549 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CAV1Q03135 178 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 WSCD1Q658N2 575 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DUPD1Q68J44 220 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PMF1Q6P1K2 205 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 BBS12Q6ZW61 710 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 USP51Q70EK9 711 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 STRADAQ7RTN6 431 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FUKQ8N0W3 1084 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SCML4Q8N228 414 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 EMC1Q8N766 993 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CCDC89Q8N998 374 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 BBOF1Q8ND07 529 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 UBA3Q8TBC4 463 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FAM71BQ8TC56 605 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 IGSF21Q96ID5 467 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 RUFY1Q96T51 708 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FMO2Q99518 471 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ACBD6Q9BR61 282 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZNF670Q9BS34 389 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DUSP16Q9BY84 665 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DCLK3Q9C098 648 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 IPPKQ9H8X2 491 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NFU1Q9UMS0 254 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms