RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 TEKT5Q96M29 485 aa22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM14Q96QK8 99 aa22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALPIP09923 528 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTPS1P17812 591 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 XRCC4Q13426 336 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP45Q70EL2 814 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFT43Q96FT9 208 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 COQ10AQ96MF6 247 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A0J9YYE9 177 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 HACD1B0YJ81 288 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOR1BO14657 336 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTSS1O43312 755 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRBC1P01850 177 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADRB1P08588 477 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFKBIAP25963 317 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRK6P43250 576 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLOD4Q9HC38 313 aa22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A0U1RQS6 177 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TJP3O95049 919 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGAVP06756 1048 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CA4P22748 312 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 HNF1BP35680 557 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CETN2P41208 172 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 YPEL5P62699 121 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 FOXK2Q01167 660 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACOX1Q15067 660 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC14A2Q15849 920 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC181Q5TID7 509 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIB3Q96RU7 358 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.07■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAPN8A6NHC0 703 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSMD11O00231 422 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDC3O75056 442 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPHB1P54762 984 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 MTM1Q13496 603 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 INPP5AQ14642 412 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 QPCTQ16769 361 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLRX5Q86SX6 157 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARGQ86W56 976 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF567Q8N184 647 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 LYSMD1Q96S90 227 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 VAT1Q99536 393 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLF15Q9UIH9 416 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 H7C0C1 242 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRDCO43847 1150 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PIAS2O75928 621 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 CSF2P04141 144 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCCBP05166 539 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 NME1P15531 152 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBL1P28749 1068 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP5OP48047 213 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 THOP1P52888 689 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGEF7Q14155 803 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTK2BQ14289 1009 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC66Q68CR7 880 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PELI3Q8N2H9 469 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC25A45Q8N413 288 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 DTD2Q96FN9 168 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOOQ9BUR5 198 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBP3P10745 1247 aa22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF30P17039 623 aa22.04■■□□□ 1.12
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