RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAUS8Q9BT25 410 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS33BQ9H267 617 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIX4Q9UIU6 781 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARDHQ9UL12 918 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCINQ9Y6U3 715 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF4O00268 1085 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFPL2O75678 378 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT36O76013 467 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDNO94850 711 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYC1P08574 325 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 G6PDP11413 515 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCD3P28288 659 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHMT1P34896 483 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GABRB2P47870 512 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRP5P59047 1200 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTF1Q16619 201 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GORABQ5T7V8 394 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR73Q6P4I2 378 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAGSQ8N159 534 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK9Q8TD19 979 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TANKQ92844 425 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM19Q96HH6 336 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TKTL2Q9H0I9 626 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR108Q9NPR9 543 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1RLQ9NZP8 487 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDP2Q9P2J9 529 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TINAGQ9UJW2 476 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 VDAC3Q9Y277 283 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JPF8 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFNL4K9M1U5 179 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAP23O00161 211 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TULP2O00295 520 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPHP1O15259 732 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC14L5O43304 696 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFSF14O43557 240 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMTA2O94983 1202 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 F9P00740 461 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXB5P09067 269 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRCP12931 536 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT3P25713 68 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNAQP50148 359 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD23BP54727 409 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLX5P56178 289 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SORDQ00796 357 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTP4A2Q12974 167 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB17Q13105 803 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBA1AQ71U36 451 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFR1Q86XK3 245 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 POC1AQ8NBT0 407 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA22Q8NHS9 363 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPM1EQ8WY54 764 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms