RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL24P83731 157 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALEQ14376 348 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPE65Q16518 533 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC96Q2M329 555 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TUBB8Q3ZCM7 444 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TECRLQ5HYJ1 363 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCST1Q5T197 706 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRNP1Q6NT89 227 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGMBQ6NW40 437 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRBA2Q6ZNG9 492 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANO5Q75V66 913 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTAGE4Q8IX94 777 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF34Q8IZ26 560 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2AK2Q8NG84 335 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMGB4Q8WW32 186 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 OMA1Q96E52 524 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAUS8Q9BT25 410 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 COLEC11Q9BWP8 271 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLPBQ9H078 707 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP62CLQ9H1M0 184 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 CERS4Q9HA82 394 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRDM8Q9NQV8 689 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATAD3AQ9NVI7 634 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL42Q9P2K6 505 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLQ9UEF7 1012 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHA6Q9UF33 1036 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDRG3Q9UGV2 375 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHDHQ9UQ10 334 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANO9A1A5B4 782 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf226A1L170 272 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR6C68A6NDL8 312 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A18PA6NE21 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A16PA6NEW6 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOL1O14791 398 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNGR3O43761 229 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP2C2O75185 946 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFB4O95168 129 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAVIN2O95810 425 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL1AP01583 271 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP21A2P08686 494 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A15PP0C7V4 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A14PP0C7W9 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPPBP16860 134 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHATP28329 748 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTNR1AP48039 350 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC6A12P48065 614 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCP4P48539 62 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BMXP51813 675 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CASP5P51878 434 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TERF1P54274 439 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HDAC4P56524 1084 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX16P57768 344 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAPSNQ13702 412 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF2H2Q13888 395 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRM3Q14832 879 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB30Q15771 203 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTF1Q16619 201 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPEG1Q2M385 716 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC35G1Q2M3R5 365 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTBD16Q32M84 506 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ESCO2Q56NI9 601 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FFAR4Q5NUL3 377 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP4R4Q6NUP7 873 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM171BQ6P995 826 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2D5Q6ZV89 423 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMTC1Q8IUR5 882 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NRSN1Q8IZ57 195 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCML4Q8N228 414 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TXLNBQ8N3L3 684 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PARP16Q8N5Y8 322 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52I2Q8NH67 350 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP70Q8NHQ1 597 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms