RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.59□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF613Q6PF04 617 aa10.59□□□□□ -0.71
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CLN8-201ENST00000331222 STK40Q8N2I9 435 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 TPK1Q9H3S4 243 aa10.58□□□□□ -0.72
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CLN8-201ENST00000331222 VIPP01282 170 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 LYNP07948 512 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ME2P23368 584 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 CXCR2P25025 360 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 SSR2P43308 183 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ZNF132P52740 706 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 ATCAYQ86WG3 371 aa10.58□□□□□ -0.72
CLN8-201ENST00000331222 OR2L3Q8NG85 312 aa10.58□□□□□ -0.72
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