RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBFAQ8N0V3 343 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G15Q8NCC3 412 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C6Q8NH72 309 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCRN2Q96FV2 425 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM14Q96QK8 99 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 DESI2Q9BSY9 194 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP41Q9BYV8 373 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIL1Q9Y3C6 166 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CST8O60676 142 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP2P08253 660 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALPIP09923 528 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 JUNDP17535 347 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGM2P21980 687 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 INPP5AQ14642 412 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFATC4Q14934 902 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOX1Q15067 660 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KAZNQ674X7 775 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP45Q70EL2 814 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN33Q86UF1 283 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC50Q8IVM0 306 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHACTR4Q8IZ21 702 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PELI3Q8N2H9 469 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXD1Q8NHP7 514 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOOQ9BUR5 198 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1A2Q9Y585 309 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRYQ5TBA9 3013 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0J9YYE9 177 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0U1RQJ8 604 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRID2IPA4D2P6 1211 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM221BA6H8Z2 402 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRLP01236 227 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBC1P01850 177 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFKBIAP25963 317 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR2C2P49116 596 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX5P50542 639 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SKOR1P84550 965 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2R5EQ16537 467 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC157Q569K6 752 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1328Q86T90 577 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCOR2Q8IZ40 523 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC57Q8N9N7 239 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUS1Q96E22 293 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC61Q9BV99 259 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHKBQ9Y259 395 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSRB2Q9Y3D2 182 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0U1RQS6 177 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7ESM1 405 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD11O00231 422 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAMP1O15126 338 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP9O43315 295 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFPL3O75679 317 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA4P22748 312 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNNA2P26232 953 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNF1BP35680 557 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETV3P41162 512 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD86P42081 329 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1024LP59773 190 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND2CQ68D51 928 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN2A2Q8WVV5 523 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATA6Q92908 595 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTD2Q96FN9 168 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEPT10Q9P0V9 454 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM10Q9UDY6 481 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP24Q9UPU5 2620 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN8A6NHC0 703 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CKMT2P17540 419 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL26P61254 145 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPARDQ03181 441 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF7Q14155 803 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG11Q2TAA5 492 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC66Q68CR7 880 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD16Q68DU8 428 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTC1Q6UUV9 634 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS13Q6UX07 377 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS12Q6ZW61 710 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms