RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SLC34A1Q06495 639 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM60Q495X7 471 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GPR158Q5T848 1215 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RMDN1Q96DB5 314 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PANX3Q96QZ0 392 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 FDXRP22570 491 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CUL3Q13618 768 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CYTH1Q15438 398 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 EXOC2Q96KP1 924 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF558Q96NG5 402 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RTKNQ9BST9 563 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 MUC3BQ9H195 1237 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC42Q9Y546 428 aa21.79■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC22A2O15244 555 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC4A1P02730 911 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 THRAP10827 490 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CCL5P13501 91 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 KCNA5P22460 613 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PMLP29590 882 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NXNQ6DKJ4 435 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ACTRT2Q8TDY3 377 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF570Q96NI8 536 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.78■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PIK3R1P27986 724 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SESN3P58005 492 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA3AQ14563 771 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TAF11Q15544 211 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PIM3Q86V86 326 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 WBP2Q969T9 261 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 FAR2Q96K12 515 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 PRRG1O14668 218 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TBX10O75333 385 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ITGAXP20702 1163 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 STC1P52823 247 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 TWF1Q12792 350 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ISCA2Q86U28 154 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 ALG9Q9H6U8 611 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.77■■□□□ 1.08
SPHK1-201ENST00000323374 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM233B4DJY2 109 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ELF1P32519 619 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 VHLP40337 213 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 RAB33AQ14088 237 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TOP1MTQ969P6 601 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PHF21BQ96EK2 531 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 C2orf81A6NN90 581 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ZMPSTE24O75844 475 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 C1RP00736 705 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PRLP01236 227 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 SUOXP51687 545 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PLK1P53350 603 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 BTKQ06187 659 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms