RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 SEMA4FO95754 770 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DNTTP04053 509 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GRK6P43250 576 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CSNK1DP48730 415 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 LMAN1P49257 510 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CCT8P50990 548 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GEMP55040 296 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 AP1S1P61966 158 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DSC2Q02487 901 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SEMA5AQ13591 1074 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SLC14A2Q15849 920 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 INAVAQ3KP66 663 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FAXCQ5TGI0 409 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PGBD5Q8N414 524 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 EXOC2Q96KP1 924 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TMEM245Q9H330 911 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SNX24Q9Y343 169 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NUMA1Q14980 2115 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TMEM131Q92545 1883 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TTC34A8MYJ7 566 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 INSIG1O15503 277 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PCDHGA12O60330 932 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 C7P10643 843 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ITIH2P19823 946 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CA4P22748 312 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MCM3P25205 808 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CD27P26842 260 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RGRP47804 291 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SCNN1BP51168 640 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CAV1Q03135 178 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RAD51Q06609 339 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MPP3Q13368 585 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CUL1Q13616 776 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CARD16Q5EG05 197 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 Q6ZVU0 165 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SRLQ86TD4 932 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 HOOK3Q86VS8 718 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PLPP6Q8IY26 295 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ZNF366Q8N895 744 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SEC14L1Q92503 715 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MYO19Q96H55 970 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SGK2Q9HBY8 427 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SUN2Q9UH99 717 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 APC2O95996 2303 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 BNIP3LO60238 219 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 DFNA5O60443 496 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FSBPO95073 299 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 APRTP07741 180 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CR2P20023 1033 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TPSB2P20231 275 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 IVDP26440 423 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CD86P42081 329 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TERF1P54274 439 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CDK16Q00536 496 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 CYP4F3Q08477 520 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 NIPAL4Q0D2K0 466 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 GRM3Q14832 879 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 MORF4L2Q15014 288 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 TPSAB1Q15661 275 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-201ENST00000322326 FRS2Q8WU20 508 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms