RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf81A6NN90 581 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF12O95522 483 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 APOA4P06727 396 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 BMP1P13497 986 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB3P29508 390 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TDP1Q9NUW8 608 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 XPR1Q9UBH6 696 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 VWA7Q9Y334 891 aa22.81■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FZD6O60353 706 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 FGF19O95750 216 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 AQP5P55064 265 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN2DP55273 166 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 RTL10Q7L3V2 364 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 HEXDCQ8WVB3 486 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MOCOSQ96EN8 888 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 OXSMQ9NWU1 459 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CDH23Q9H251 3354 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TARM1B6A8C7 271 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CA3P07451 260 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-FP30511 346 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HOXA9P31269 272 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GKP32189 559 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LMLNQ96KR4 655 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ACSS2Q9NR19 701 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM13O60858 407 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CSHL1Q14406 222 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 RDH11Q8TC12 318 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 SKA1Q96BD8 255 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GPAMQ9HCL2 828 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 MID2Q9UJV3 735 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 AP1S1P61966 158 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.79■■□□□ 1.24
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VSTM4-201ENST00000298454 TTC8Q8TAM2 541 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PNPOQ9NVS9 261 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.79■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 XYLBO75191 536 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PIGNO95427 931 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 RB1P06400 928 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CTPS1P17812 591 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 EPHB1P54762 984 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ING5Q8WYH8 240 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 UNC5CO95185 931 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA3P25788 255 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 PMLP29590 882 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 STC1P52823 247 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB16Q05516 673 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.77■■□□□ 1.24
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.77■■□□□ 1.24
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