RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 GPR25O00155 361 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCNA10Q16322 511 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FATE1Q969F0 183 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ZNF607Q96SK3 696 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 H0YC42 278 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 ARL15Q9NXU5 204 aa6.35□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.35□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GPR141Q7Z602 305 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MYO19Q96H55 970 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MIOSQ9NXC5 875 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.35□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 F8W810 466 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SASH3O75995 380 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 UBOX5O94941 541 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 BLKP51451 505 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GYS2P54840 703 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 PEX10O60683 326 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C7P10643 843 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PROZP22891 400 aa6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 EXD2Q9NVH0 621 aa6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 BTN3A1O00481 513 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 DNAJB5O75953 348 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C1RP00736 705 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 IL6P05231 212 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 HMBSP08397 361 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 CCNA2P20248 432 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GAD2Q05329 585 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 GALNT7Q86SF2 657 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SEMA4DQ92854 862 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 C1orf50Q9BV19 199 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ACSL4O60488 711 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 SERPINB7O75635 380 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ITGADQ13349 1161 aa6.34□□□□□ -1.39
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SETX-201ENST00000224140 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.34□□□□□ -1.39
SETX-201ENST00000224140 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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