RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.65□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 HECTD3Q5T447 861 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 MTX3Q5HYI7 312 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 C17orf50Q8WW18 174 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC25A3Q00325 362 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MPZL3Q6UWV2 235 aa14.64□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.64□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CAMTA2O94983 1202 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 MXD1Q05195 221 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SUSD6Q92537 303 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 FCGRTP55899 365 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 COMTD1Q86VU5 262 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PIGBQ92521 554 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 DNASE1L2Q92874 299 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 GMIPQ9P107 970 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 AASSQ9UDR5 926 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 MAGEC1O60732 1142 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.074e-7■■■□□ 16.8
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SPTLC2-201ENST00000216484 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 COQ8BQ96D53 544 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PTPRTO14522 1441 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CD86P42081 329 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 SCN1BQ07699 218 aa14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM205CA6NFA0 338 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 PER2O15055 1255 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 CRADDP78560 199 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 FUT8Q9BYC5 575 aa14.63□□□□□ -0.07
SPTLC2-201ENST00000216484 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.62□□□□□ -0.07
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