RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MIB1Q86YT6 1006 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LILRA2Q8N149 483 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MARVELD2Q8N4S9 558 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GPR150Q8NGU9 434 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GPR152Q8TDT2 470 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASB9Q96DX5 294 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SEMA3CQ99985 751 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.11■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GPC4O75487 556 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARSAP15289 507 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FDXRP22570 491 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CHN2P52757 468 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FAM189BP81408 668 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LAMB3Q13751 1172 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AGKQ53H12 422 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PIM3Q86V86 326 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FEM1CQ96JP0 617 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADA2Q9NZK5 511 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VWA8A3KMH1 1905 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FBP2O00757 339 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TXNDC9O14530 226 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPOP01588 193 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC10A3P09131 477 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HLA-DPA1P20036 260 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TLR1Q15399 786 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LIN52Q52LA3 116 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UNC50Q53HI1 259 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTERQ96BW5 349 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CENPKQ9BS16 269 aa22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRAMEF11O60813 436 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DNAJA2O60884 412 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUPT7LO94864 414 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GLP2RO95838 553 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FGF1P05230 155 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 OR1E1P30953 314 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ACVRL1P37023 503 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 REP15Q6BDI9 236 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.131e-6■□□□□ 8.2
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.133e-6■■■□□ 16.1
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RAB26Q9ULW5 256 aa22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SLC12A8A0AV02 714 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 E7ENX8 843 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CD1DP15813 335 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAPKAPK2P49137 400 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HERVK_113P63132 956 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TAF10Q12962 218 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RASIP1Q5U651 963 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TOP1MTQ969P6 601 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PKP2Q99959 881 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 Q9H521 79 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CEP350Q5VT06 3117 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MUSKO15146 869 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GJB3O75712 270 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 HMBSP08397 361 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CKBP12277 381 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP4BP51164 291 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SUOXP51687 545 aa22.08■■□□□ 1.13
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RING1Q06587 406 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms