RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Ttl-201ENSMUST00000035812 EcsitQ9QZH6 435 aa16.27■□□□□ 0.2
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zc3h12bG3X9I7 835 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc39a4Q78IQ7 660 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mterf2Q8BKY8 385 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 PvrQ8K094 408 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cdc16Q8R349 620 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tmem80Q9D3H0 123 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc97Q9DBT3 340 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa16.27■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 NuggcD3YWJ0 796 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Adam19O35674 920 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cxcr2P35343 359 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mc1rQ01727 315 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Hhla1Q3TYV2 514 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 LnpkQ7TQ95 425 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam161aQ8QZV6 448 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 NlnQ91YP2 704 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Oser1Q9D722 291 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fgf22Q9ESS2 162 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tbk1Q9WUN2 729 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm5861F6VCN9 180 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 4933402N22RikF7D1B3 190 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sema3aO08665 772 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Naa11Q3UX61 218 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc22a16Q497L8 649 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Abcd2Q61285 741 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pcdhga9Q91XX9 932 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ncam2O35136 837 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dlg3P70175 849 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sh3bp2Q06649 559 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nipal4Q8BZF2 406 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Klhl2Q8JZP3 593 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Olfr665Q8VG79 316 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Commd8Q9CZG3 183 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 L3mbtl1A2A5N8 826 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 AccsA2AIG8 502 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ebf3O08791 596 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Efemp1Q8BPB5 493 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc63Q8CDV6 558 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 LzicQ8K3C3 190 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Olfr853Q8VGG6 305 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arl10Q9QXJ4 243 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Spry1Q9QXV9 313 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lgals7O54974 136 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 H2-Q7P14429 334 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 H2-Q9P14431 200 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Bmp1P98063 991 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc6a4Q60857 630 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Map3k3Q61084 626 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 CcnhQ61458 323 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 PnocQ64387 187 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 CntrobQ8CB62 887 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 NaprtQ8CC86 538 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zbed6D2EAC2 980 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rhox5P52651 210 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Myadml2Q08AU7 307 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vat1Q62465 406 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Plekha8Q80W71 519 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ppil6Q9D6D8 278 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Bace2Q9JL18 514 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pias4Q9JM05 507 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gpr21Q8BX79 349 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc39a13Q8BZH0 361 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pacs1Q8K212 961 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rsph1Q8VIG3 301 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sec14l2Q99J08 403 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Terb2Q9D494 218 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Q9D979 236 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Serpinb6cW4VSP4 379 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 DgkdE9PUQ8 1220 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm3159K7N760 267 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 S100a5P63084 93 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfyve27Q3TXX3 415 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Scn2bQ56A07 215 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc47a1Q8K0H1 567 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Snx15Q91WE1 337 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 AslQ91YI0 464 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 LiasQ99M04 373 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cmc1Q9CPZ8 106 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pik3r2O08908 722 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ctnnd2O35927 1247 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rab10P61027 200 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sephs2P97364 452 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms