RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035721.13

Prpf18-201, Transcript of Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf18, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slurp2P0DP59 97 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gstp2P46425 210 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 SmoP56726 793 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 EsrrgP62509 458 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Fam83hQ148V8 1209 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tmc5Q32NZ6 967 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 HgsnatQ3UDW8 656 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm10662Q3UT86 313 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 SynaQ5G5D5 617 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 ManeaQ6NXH2 462 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc39a14Q75N73 489 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tcp10aQ80W76 438 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 ChfrQ810L3 664 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zbtb41Q811F1 908 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Hirip3Q8BLH7 601 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cpne3Q8BT60 533 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zfp120Q8BZW4 436 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rcor2Q8C796 523 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zfp263Q8CF60 680 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Olfr801Q8VEU1 318 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nsmce2Q91VT1 247 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Eva1aQ91WM6 156 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Bap1Q99PU7 728 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Lamtor1Q9CQ22 161 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Q9D1K7 174 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Actr6Q9D864 396 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Hmg20aQ9DC33 346 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Krt7Q9DCV7 457 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Smok2bQ9QYZ3 484 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cldn3Q9Z0G9 219 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gli3Q61602 1583 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Itih4A6X935 942 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Trabd2bB1ATG9 517 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Apol11bE9PUZ0 337 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 TyrobpO54885 114 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Prl3b1P09586 222 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rhox5P52651 210 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 PltpP55065 493 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tspan5P62080 268 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tgtp2Q3T9E4 415 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tgtp1Q62293 415 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Adam6bQ6IMH7 756 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 GypcQ78HU7 95 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zfp184Q7TSH9 737 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Q80WR5 230 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Kctd3Q8BFX3 815 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tmem145Q8C4U2 746 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 TwnkQ8CIW5 685 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Clec4a3Q8JZX6 237 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Fcho1Q8K285 873 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Degs2Q8R2F2 323 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zmym2Q9CU65 1376 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 EvplQ9D952 2035 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 AcadsbQ9DBL1 432 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nudt12Q9DCN1 462 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 DiabloQ9JIQ3 237 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Htra1Q9R118 480 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 UxtQ9WTZ0 157 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tnni1Q9WUZ5 187 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 CorinQ9Z319 1113 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc16a6B1AT66 607 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm4907B1AXB9 411 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Kcnk16G5E845 292 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm21915J3QPM7 133 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm8857L7N291 182 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Syt2P46097 422 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Foxp2P58463 714 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 ArsiQ32KI9 573 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Smyd5Q3TYX3 416 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Myo19Q5SV80 963 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Celf4Q7TSY6 486 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Q8BTG6 205 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Fam131aQ8BWU3 361 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nemp2Q8CB65 421 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 FbrsQ8R089 466 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc22a19Q8VCA0 551 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Sorcs3Q8VI51 1219 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gorasp1Q91X51 446 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc6a19Q9D687 634 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 P2yr13Q9D8I2 337 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 TrmuQ9DAT5 417 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Wdr12Q9JJA4 423 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ubqln2Q9QZM0 638 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Anapc7Q9WVM3 565 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Mapk7Q9WVS8 806 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Uba2Q9Z1F9 638 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Man1b1A2AJ15 658 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.6 ms