RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf689Q8BKK5 500 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam204aQ8C6C7 236 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc63Q8CDV6 558 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creld1Q91XD7 420 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf111Q99ML9 989 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm12Q9D0R8 195 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clec1bQ9JL99 229 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn8aQ9WTU3 1978 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa8Q8CC88 1905 aa12.72□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcm1Q9R0L6 2025 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grin3aA2AIR5 1135 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UprtB1AVZ0 310 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4f17G3UW78 524 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkx1-1G3UXB3 402 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r67K7N6T2 851 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpaO35216 134 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcn3O88705 779 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpy19l2P0CW70 773 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn10P28658 475 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf5P43027 495 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhx3P50481 400 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps24P62849 133 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mc1rQ01727 315 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem255bQ5FW56 369 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf148Q61624 794 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TbcdQ8BYA0 1196 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4f16Q99N17 524 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oser1Q9D722 291 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgam1Q9DBJ1 254 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MkksQ9JI70 570 aa12.71□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh18E9Q9Q6 790 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi206G3UZV2 921 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KlO35082 1014 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neu1O35657 409 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1qbpO35658 278 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01641 117 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh5P55284 784 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpdl3aP70158 445 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd13P70217 339 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300lgQ1ERP8 331 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E330034G19RikQ3UWX6 351 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScinQ60604 715 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcal1Q8BJL0 910 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim14Q8BVW3 440 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smoc2Q8CD91 447 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrnp27Q8K194 155 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ipo11Q8K2V6 975 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhga10Q91XY9 930 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spg21Q9CQC8 308 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TsaccQ9DA44 124 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp19Q9JHI0 527 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gde1Q9JL56 331 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpc4Q9QUQ5 974 aa12.71□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgxb3G3X9M3 1254 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkag1O54950 330 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IkbkgO88522 412 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd8P23463 289 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp17a1P27786 507 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl17Q3U2U7 461 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam129aQ3UW53 926 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrg1Q6DR99 700 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnma8aQ80VM8 430 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cept1Q8BGS7 416 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acsl5Q8JZR0 683 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam32Q8K410 754 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtse1Q8R080 741 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 March2Q99M02 246 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrf1Q9WU00 503 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bscl2Q9Z2E9 383 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map7d3A2AEY4 876 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Skint6A7XUZ6 1240 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sbk3P0C5K0 361 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v0d1P51863 351 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zyg11bQ3UFS0 744 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmed1Q3V009 227 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clhc1Q5M6W3 596 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst10Q6PGK7 356 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930503B20RikQ80ZP0 234 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Suds3Q8BR65 328 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc41a2Q8BYR8 573 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snapc1Q8K0S9 389 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NeproQ8R2U2 564 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc30bQ9CY00 664 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd12Q9D8W5 456 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrgbpQ9DAT2 204 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Maged2Q9ER67 616 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpkQ9ESN5 271 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl5a1Q9JII2 230 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cog8Q9JJA2 640 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbk1Q9WUN2 729 aa12.7□□□□□ -0.38
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms