RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021288.9

Usp43-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp43, Length 4,462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43-201ENSMUST00000021288 Il6raP22272 460 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gsta3P30115 221 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rasa4Q6PFQ7 802 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snx32Q80ZJ7 404 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 PstkQ8BP74 359 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Serpinb1aQ9D154 379 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ccdc81Q9D5W4 654 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 FgaE9PV24 789 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Prox1P48437 737 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Col6a2Q02788 1034 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pdlim7Q3TJD7 457 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ag2Q3UPL5 249 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tmem45aQ60774 273 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 GnasQ6R0H7 1133 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cand1Q6ZQ38 1230 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr533Q7TRT7 320 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Casp9Q8C3Q9 454 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lrif1Q8CDD9 755 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ston1Q8CDJ8 730 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Acsm2Q8K0L3 575 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr345Q8VGK4 311 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pofut2Q8VHI3 429 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Wdr55Q9CX97 388 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 B4galt4Q9JJ04 344 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fbxo17Q9QZM8 286 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mpp2Q9WV34 552 aa15.37■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zfp472B0V2W5 534 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cyp2b19O55071 492 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 B3gnt3Q5JCS9 372 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Insm1Q63ZV0 521 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 AtminQ6P9S1 818 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mfsd14bQ8CIA9 507 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mtg1Q8R2R6 326 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scd3Q99PL7 359 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 GraspQ9JJA9 392 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Vmn2r14E9Q759 848 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 PdgfaP20033 211 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 St14P56677 855 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Coq10bQ3THF9 240 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr1105Q7TR58 312 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lrrc17Q9CXD9 443 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 CenpsQ9D084 142 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Trim12cD3Z3L3 497 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm17093F6XGJ4 214 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ccnb1P24860 430 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nfkb1P25799 971 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Arnt2Q61324 712 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Six3Q62233 333 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mon1aQ6PDG8 556 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ppp1r16aQ923M0 524 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Marc1Q9CW42 340 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gdap2Q9DBL2 498 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Jph2Q9ET78 696 aa15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Wfdc16A2A5H4 111 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 UprtB1AVZ0 310 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Speer4cG3UXD1 256 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm10354K7N6A0 256 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Naa11Q3UX61 218 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ntan1Q64311 310 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Scube1Q6NZL8 1018 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stk32aQ8BGW6 398 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 FicdQ8BIX9 458 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nck1Q99M51 377 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Jam2Q9JI59 298 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Elf4Q9Z2U4 655 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stk25Q9Z2W1 426 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Olfr292F8VQ84 308 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Orm2P07361 207 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 LtfP08071 707 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nr5a2P45448 560 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hoxc13P50207 328 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Dok6Q2MHE5 331 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Jak2Q62120 1129 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pfkfb4Q6DTY7 469 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Atp2c1Q80XR2 918 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Prdm8Q8BZ97 687 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gramd1aQ8VEF1 722 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snrnp48Q9D361 337 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Znf711A2ANX9 761 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ttll8A4Q9F1 832 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam46dB1ATX6 390 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Spin2dB1B0R2 236 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rps24P62849 133 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam110bQ8C739 366 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 EbplQ9D0P0 206 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hormad1Q9D5T7 392 aa15.35■□□□□ 0.05
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm10719E9Q7T3 227 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.6 ms