RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bcl6P41183 707 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AurkaP97477 395 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nudt18Q3U2V3 323 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ripor1Q68FE6 1223 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AtminQ6P9S1 818 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AgpsQ8C0I1 645 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Alg9Q8VDI9 611 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zdhhc7Q91WU6 308 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atad3Q925I1 591 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 L3hypdhQ9CXA2 354 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nt5c3aQ9D020 331 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PllpQ9DCU2 182 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il20Q9JKV9 176 aa18.3■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tcte1A6H639 498 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp212G3X8R7 492 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccl4P14097 92 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd9P40240 226 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myl2P51667 166 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uhmk1P97343 419 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Otol1Q4ZJM7 482 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eri2Q5BKS4 688 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtprcapQ64697 197 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Xlr3bQ6P205 226 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DgkqQ6P5E8 934 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1062Q7TR71 315 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 C2cd2lQ80X80 706 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf426Q8R1D1 550 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxe1Q8R2I0 371 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc42Q8R2U7 421 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ten1Q9D7K2 161 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aldh18a1Q9Z110 795 aa18.29■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bub1O08901 1058 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdh1P09803 884 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adh5P28474 374 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rps3P62908 243 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nat9Q3UG98 241 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 EndouQ3V188 412 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dyrk2Q5U4C9 599 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mtnr1aQ61184 353 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pabpc2Q62029 628 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atg16l2Q6KAU8 623 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr765Q7TRI6 309 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dyrk4Q8BI55 632 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CenpuQ8C4M7 410 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cwf19l1Q8CI33 537 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dedd2Q8QZV0 330 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr767Q8VG33 309 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VitQ8VHI5 650 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc3Q91YW3 504 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tchhl1Q9D3P1 638 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adam21Q9JI76 729 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Msh5Q9QUM7 833 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sgk2Q9QZS5 367 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nphs1Q9QZS7 1256 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 B9d1Q9R1S0 204 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif9Q9WV04 790 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RecqlQ9Z129 648 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdh23Q99PF4 3354 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Socs5O54928 536 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pdcd2P46718 343 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ntsr2P70310 416 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankmy2Q3TPE9 440 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem184cQ3TPR7 525 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Drc1Q3USS3 753 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rftn1Q6A0D4 554 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep104Q80V31 926 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Exoc3l1Q8BI71 739 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Clec4a3Q8JZX6 237 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prb1Q91X93 504 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc30a1Q99J38 664 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mlf2Q99KX1 247 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr6Q99ME2 1125 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TMEM121BQ99MX7 572 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ska2Q9CR46 120 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bcl7aQ9CXE2 210 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttc30bQ9CY00 664 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Terb2Q9D494 218 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdyl2Q9D5D8 503 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r25W4VSP2 855 aa18.28■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd34aB2RW11 495 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxl18E9PYR1 771 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp169E9Q3R6 731 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm597E9Q8J5 896 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm8108K7N734 216 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnase1l3O55070 310 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ldb2O55203 373 aa18.27■□□□□ 0.52
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adcy1O88444 1118 aa18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms