RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627968.2

HIVEP1-209, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 8,924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-209ENST00000627968 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 CHRNB3Q05901 458 aa11.93□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 USP1O94782 785 aa11.93□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 H3BMM5 538 aa11.93□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 25
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HIVEP1-209ENST00000627968 UGT1A6P19224 532 aa11.92□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.92□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.92□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 RBFAQ8N0V3 343 aa11.92□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 FBXL18Q96ME1 805 aa11.92□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 OR2AG1Q9H205 316 aa11.92□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HIVEP1-209ENST00000627968 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.92□□□□□ -0.5
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HIVEP1-209ENST00000627968 C17orf99Q6UX52 265 aa11.92□□□□□ -0.5
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