RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 SPASTQ9UBP0 616 aa22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SRRT-218ENST00000620394 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ITGA2BP08514 1039 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PCK1P35558 622 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CLN3Q13286 438 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 IL12RB2Q99665 862 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 BOCQ9BWV1 1114 aa22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CCDC187A0A096LP49 1063 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LMO7DNF2Z398 122 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 RPIAP49247 311 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CSRP3P50461 194 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PEX5P50542 639 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 DPYSL2Q16555 572 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LMX1AQ8TE12 382 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 GLMNQ92990 594 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SPTA1P02549 2419 aa22.19■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CFAP69A5D8W1 941 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 GCATO75600 419 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PALMO75781 387 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TNFSF15O95150 251 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SERPINA4P29622 427 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PBX1P40424 430 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PDX1P52945 283 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 IL10RBQ08334 325 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LRRC14Q15048 493 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 HGSNATQ68CP4 663 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ERAP2Q6P179 960 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SRLQ86TD4 932 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LZTR1Q8N653 840 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SPOCK2Q92563 424 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 FAM117AQ9C073 453 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SP110Q9HB58 689 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.18■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQJ5 194 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 DAPK3O43293 454 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SKILP12757 684 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 IL1R2P27930 398 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 RALGDSQ12967 914 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SPIDRQ14159 915 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PERM1Q5SV97 790 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CFAP58Q5T655 872 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PSKH2Q96QS6 385 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 CLPBQ9H078 707 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ZWILCHQ9H900 591 aa22.17■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 DFFAO00273 331 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 MUSKO15146 869 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SERPINC1P01008 464 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LIG3P49916 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 BLKP51451 505 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PPARDQ03181 441 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 NFATC4Q14934 902 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 ZNF599Q96NL3 588 aa22.16■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 H3BRJ5 948 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TCF4P15884 667 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TSHRP16473 764 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 AP1S1P61966 158 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 NFATC3Q12968 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 MTM1Q13496 603 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 XKR5Q6UX68 686 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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