RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607388.1

RPF2-204, Transcript of ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPF2, Length 3,621 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2-204ENST00000607388 TMEM110Q86TL2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 TRIM74Q86UV6 250 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 TRIM73Q86UV7 250 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ANKRD46Q86W74 232 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 GIPC2Q8TF65 315 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZNF560Q96MR9 790 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 RTKNQ9BST9 563 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ASB14A6NK59 587 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 A8MU76 341 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 AP3B1O00203 1094 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 BTN3A1O00481 513 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 SOCS2O14508 198 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ABLIM1O14639 778 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 PAGE1O75459 146 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 AP2A1O95782 977 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 PIGRP01833 764 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 DGKQP52824 942 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 SLC18A1P54219 525 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 DAB2P98082 770 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZNF235Q14590 738 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 C14orf80Q86SX3 495 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 VPS45Q9NRW7 570 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 OXSMQ9NWU1 459 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 SELENONQ9NZV5 590 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 IPPQ9Y573 584 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 VCANP13611 3396 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 C5orf42Q9H799 3197 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 SYCE1LA8MT33 242 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 TPSAB1Q15661 275 aa6.5□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 RNF112Q9ULX5 631 aa6.5□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.49□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 CNTN5O94779 1100 aa6.49□□□□□ -1.37
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RPF2-204ENST00000607388 TRIM16O95361 564 aa6.49□□□□□ -1.37
RPF2-204ENST00000607388 HLA-DQB2P05538 268 aa6.49□□□□□ -1.37
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