RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLC3Q6P597 504 aa11.83□□□□□ -0.52
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDSS2Q86YH6 399 aa11.83□□□□□ -0.52
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIDD1Q9HB75 910 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL37Q9NZH6 218 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM92AA1XBS5 289 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAPN8A6NHC0 703 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DRGXA6NNA5 263 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAM12O43184 909 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RGRP47804 291 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC11A1P49279 550 aa11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL10RBQ08334 325 aa11.83□□□□□ -0.52
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