RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 DKK3Q9UBP4 350 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 A8MX80 341 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PMS2P54278 862 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SEPT6Q14141 434 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CST6Q15828 149 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CRY1Q16526 586 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CES3Q6UWW8 571 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ARRDC3Q96B67 414 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SCRN2Q96FV2 425 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TECTAO75443 2155 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MID1O15344 667 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ACSL3O95573 720 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC4A1P02730 911 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TIMP2P16035 220 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ITGB7P26010 798 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 HNF1BP35680 557 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PCID2Q5JVF3 399 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PJA1Q8NG27 643 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MFSD3Q96ES6 412 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CFAP36Q96G28 342 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ARL5AQ9Y689 179 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 A0A1W2PQ67 120 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TSPAN11A1L157 253 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 LDB2O43679 373 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TTC4O95801 387 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SSTR1P30872 391 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 USP45Q70EL2 814 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PALM2Q8IXS6 379 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 DYRK4Q9NR20 520 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 KCTD3Q9Y597 815 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CAPN8A6NHC0 703 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ADRA1DP25100 572 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM193AP78312 1265 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM135Q86UB9 458 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 AADATQ8N5Z0 425 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ANKRD7Q92527 254 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 NAT9Q9BTE0 207 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 KIFC1Q9BW19 673 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SOX13Q9UN79 622 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MYLKQ15746 1914 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MAGEB16A2A368 324 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 HEATR9A2RTY3 570 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 MROH6A6NGR9 719 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 DYNC1I1O14576 645 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PGAM1P18669 254 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 NMBRP28336 390 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 DRD3P35462 400 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 HSD17B3P37058 310 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 GPX6P59796 221 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 CNTN1Q12860 1018 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 PTPRCAPQ14761 206 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-223ENST00000592576 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms