RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 CA9Q16790 459 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CCNJLQ8IV13 435 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 MED8Q96G25 268 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CNPY3Q9BT09 278 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 STRADBQ9C0K7 418 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 FANCLQ9NW38 375 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.62■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ANKRD62A6NC57 917 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 A8MX80 341 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PRAMEF11O60813 436 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TPM2P07951 284 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 RALGDSQ12967 914 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SRLQ86TD4 932 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PELI3Q8N2H9 469 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PAF1Q8N7H5 531 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 NEK11Q8NG66 645 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 AGPAT1Q99943 283 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.61■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 NAV2Q8IVL1 2488 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SLC28A2O43868 658 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 NOBOXO60393 691 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TNFP01375 233 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 JMJD7P0C870 316 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 GM2AP17900 193 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SERPINA4P29622 427 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TAF8Q7Z7C8 310 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 VASH2Q86V25 355 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 EXD3Q8N9H8 876 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 GPR156Q8NFN8 814 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ATL2Q8NHH9 583 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PEBP4Q96S96 227 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TMEM168Q9H0V1 697 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.6■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PTPN13Q12923 2485 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ELFN1P0C7U0 828 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CCKBRP32239 447 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ETV5P41161 510 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 AIF1P55008 147 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 KIAA1024LP59773 190 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 GRM3Q14832 879 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 AGERQ15109 404 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 LIPIQ6XZB0 460 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SPRED1Q7Z699 444 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 NPWQ8N729 165 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TMEM74Q96NL1 305 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 LGR4Q9BXB1 951 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 CYP4F12Q9HCS2 524 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 SDK2Q58EX2 2172 aa15.59■□□□□ 0.09
NME3-211ENST00000568561 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP42A6NI28 874 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 LGALS16A8MUM7 142 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 DFFAO00273 331 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 PRAMEF10O60809 474 aa15.58■□□□□ 0.08
NME3-211ENST00000568561 PALMO75781 387 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms