RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PADI4Q9UM07 663 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYO6Q9UM54 1294 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SATB2Q9UPW6 733 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.22□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.21□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.21□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KLK10O43240 276 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LSSP48449 732 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MMRN1Q13201 1228 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT81Q14533 505 aa7.2□□□□□ -1.26
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CNGA3Q16281 694 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.2□□□□□ -1.26
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